基因組重測序揭示湖南4個典型地方茶樹群體資源的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和遺傳結(jié)構(gòu)
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基因組重測序揭示湖南4個典型地方茶樹群體資源的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和遺傳結(jié)構(gòu)

01

研究背景

湖南不僅位于茶樹起源中心云貴高原的邊緣區(qū)域,而且處于華南茶區(qū)與江南茶區(qū)的交匯處,獨(dú)特的地理和氣候條件形成了豐富的茶樹資源類型,代表性的有汝城白毛茶、江華苦茶、城步峒茶和安化云臺山種,這些茶樹資源不僅在分類上各有特點(diǎn),而且在生化成分、適制性和耐寒性等方面差異較大。前人已采用形態(tài)、細(xì)胞、生化和分子標(biāo)記等手段,揭示了地方群體間的親緣關(guān)系,對不同群體資源的演化途徑提出了假設(shè),但茶樹作為一種多年生、自交不親和的經(jīng)濟(jì)作物,長期的引種馴化,使得其遺傳背景復(fù)雜,單從形態(tài)和有限的標(biāo)記入手來探討其遺傳演化過程存在著一定的局限性。

02

本文的重要發(fā)現(xiàn)或者創(chuàng)新點(diǎn)

本研究采用重測序技術(shù)對城步峒茶(CBDC)、江華苦茶(JHKC)、汝城白毛(RCBM)和安化云臺種(AHYT)4個湖南典型地方茶樹群體的36份資源進(jìn)行了基因組測序,并結(jié)合已完成測序的62份茶樹種質(zhì)資源,進(jìn)行了遺傳變異、群體結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)發(fā)育研究。結(jié)果表明,湖南4個典型地方茶樹種質(zhì)資源主要分為2大類(圖1),江華苦茶和汝城白毛茶聚為一類,城步峒茶和安化云臺山種聚為一類,安化云臺種與城步峒茶的分化系數(shù)最小,而與汝城白毛茶的分化系數(shù)最大,這與前人的研究結(jié)果不完全一致。

圖1 4個典型地方茶樹種質(zhì)資源的群體遺傳結(jié)構(gòu)

以CBDC、JHKC和RCBM為對照,在栽培型的AHYT中分別鑒定出407、380和147個受選擇基因(圖2),這些基因主要與茶樹脅迫耐受性、次生代謝產(chǎn)物合成和產(chǎn)量等相關(guān)。比如汝城白毛茶雖然具有優(yōu)異的紅茶和白茶加工品質(zhì),但由于其生長勢弱、扦插成活率低等原因,限制了其產(chǎn)業(yè)化推廣,本研究在RCBM中,鑒定出了在茶樹中已報(bào)到的CsCAD3基因,該基因可能與茶樹的木質(zhì)素合成有關(guān)。除在CBDC中鑒定出了與咖啡堿合成相關(guān)的基因(CsTCS2)外,CBDC和JHKC的受選擇基因主要與低溫脅迫和芽的萌發(fā)有關(guān),這與AHYT與其他三個群體相比,抗寒性、適應(yīng)性和產(chǎn)量是主要優(yōu)勢的結(jié)論一致。

圖2 安化云臺種中挖掘的受選擇基因

03

本文作者簡介、本文資助基金情況和本課題組簡要介紹

1. 作者簡介

第一作者,劉振,湖南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所,研究員,主要從事茶樹種質(zhì)資源與育種研究;

通訊作者,楊陽,湖南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所,研究員,主要從事茶樹種質(zhì)資源與育種研究;

趙洋、楊培迪、成楊、黃飛毅、李賽君均來自湖南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所。

2. 本文資助基金

國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-19)、國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31500565)、湖南省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2021JC007)。

3. 本課題組簡要介紹

湖南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所茶樹種質(zhì)資源與育種團(tuán)隊(duì),現(xiàn)有成員16人,其中高級職稱12人,博、碩士研究生8人,建有國家中小葉茶樹種質(zhì)資源圃(長沙)、國家茶樹改良中心湖南分中心、農(nóng)業(yè)部湖南茶樹及茶葉加工科學(xué)觀測實(shí)驗(yàn)站、湖南省茶樹品種與種苗技術(shù)研究中心等國家(省)級育種創(chuàng)新平臺4個。團(tuán)隊(duì)面向茶樹種業(yè)需求,長期致力于茶樹種質(zhì)資源收集、保存與鑒定評價(jià),優(yōu)異種質(zhì)挖掘與創(chuàng)新利用,育種方法與理論研究,優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、高(多)抗茶樹特色新品種選育。

來源:中國茶葉學(xué)會

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