近日，中國農業(yè)科學院茶葉研究所茶樹遺傳育種團隊基于‘龍井43’基因組參考序列和茶樹重測序數據，開發(fā)出一款200K茶樹SNP芯片。
該芯片是首款茶樹高密度SNP芯片，以‘龍井43’(♀)和‘白毫早’(♂)F1群體為材料，該芯片能夠將18226個SNP位點繪入圖譜，獲得5325個bin-marker，連鎖圖譜總長度為2107.01cM，相鄰標記平均遺傳圖距為0.39cM，構建了目前遺傳密度最高的連鎖圖譜。
實驗驗證表明，該芯片可以有效定位關鍵QTL位點，發(fā)掘茶樹重要功能基因。利用其對不同茶樹品種的SNP分型研究，發(fā)現茶樹大葉種和小葉種之間的兩個強選擇位點，這為揭示茶樹品質調控關鍵基因和兩個變種間的進化關系有重要意義。
相關論文以“Development of a genome-wide 200K SNP array and its application for high-density genetic mapping and origin analysis of Camellia sinensis”為題，發(fā)表在植物學領域頂尖期刊Plant Biotechnology Journal 雜志上。
中國農業(yè)科學院茶葉研究所為該論文第一完成單位，韋康研究員、王新超研究員等為共同第一作者，成浩研究員、王麗鴛研究員為共同通訊作者。麗水市農林科學研究院、云南省農業(yè)科學院茶葉研究所等單位也參加本研究。本研究得到了國家重點研發(fā)項目、院創(chuàng)新工程、國家自然科學基金和浙江省農業(yè)新品種重大選育專項等項目的支持。
來源：湖北茶葉
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