一、選料不同
1、祁門紅茶鮮葉選料為“櫧葉種”茶葉。櫧葉種茶葉，葉形為橢圓或長橢圓形，葉質(zhì)柔軟。一芽二葉蒸青茶樣化驗數(shù)據(jù)顯示，其多酚類含量為31.11%，水浸出物含量為44.72%，兒茶素總量為146.59mg/g，氨基酸總量為5.42%。櫧葉種茶葉內(nèi)含物豐富，酶活性高，也適合制作綠茶。 
2、滇紅茶鮮葉選料為“云南大葉種”茶葉。滇紅主產(chǎn)區(qū)位于滇西南瀾滄江以西，怒江以東的高山峽谷區(qū)，包括臨滄的鳳慶縣、版納的勐?？h、雙江、保山的昌寧縣等這些地區(qū)的茶樹生長環(huán)境土壤多以磚紅壤和赤紅壤為主，土質(zhì)疏松、腐質(zhì)土深厚，故茶葉內(nèi)含物質(zhì)豐富。以鳳慶大葉種茶葉為例，一芽二葉蒸青茶樣含茶多酚30.19%，兒茶素總量134．19毫克/克，氨基酸2.90%，咖啡堿3.56%，水浸出物45.83%。 
二、干茶特點不同
1、祁門紅茶，其條索緊秀有鋒苗，茶葉外形纖巧緊結(jié)，苗秀顯毫，色澤烏潤。 
2、滇紅茶干茶身骨重實，色澤烏潤或紅褐且勻凈，茸毫顯露。以南茗佳人“紅顏”為例，這款茶精選臨滄鳳慶大葉種茶芽孢打造而成，其條索肥壯緊實，色澤紅褐亮麗，金毫顯著。
三、香氣不同
1、滇紅茶的香氣高揚清勁?；ü泔@著，濃而不艷，有種沁人心脾的感覺。
2、祁門紅茶的香氣較馥郁，其中以蜜糖香、果香為主，上品祁紅略顯蘭花香，此種香氣被茶業(yè)界稱為“祁門香”。
四、滋味不同
1、滇紅茶的茶湯紅透明亮，金圈突出。其滋味豐潤飽滿，刺激性強，回味鮮爽。此外，滇紅茶適合制作調(diào)飲茶，其滋味特色為：濃、強、鮮。如，加牛奶后仍有較強茶味，奶香與茶香相得益彰。 
2、祁門紅茶湯色似琥珀色，鮮艷明亮，金圈厚而艷。其滋味醇厚，甘鮮且回味綿長。
五、葉底不同
1、祁門紅茶葉底葉芽色澤紅艷，細嫩柔軟。
2、滇紅茶葉底肥厚紅潤。
