茶樹是我國重要的經(jīng)濟作物。高度雜合的二倍體茶樹，其參考基因組的組裝結果混雜了雙親等位基因組的嵌合序列，盡管這樣的組裝便于比較和分析數(shù)據(jù)，但都忽略了可能具有潛在生物學功能并影響高度雜合基因組質(zhì)量的等位基因變異。迄今為止，已在舒茶早、龍井43、碧云等綠茶品種上組裝了高質(zhì)量的染色體級別基因組，但未見烏龍茶品種基因組研究報道。
黃旦，又名黃棪、黃金桂，是福建省主栽的優(yōu)良茶樹品種，于1985年通過全國農(nóng)作物品種審定委員會的認定(編號：GS13008-1985);2018年通過國家非主要農(nóng)作物品種登記(GPD茶樹(2018)350003)。黃旦不僅是國家烏龍茶新品種選育的對照種，而且作為高香優(yōu)質(zhì)骨干親本，已培育出一系列優(yōu)良的雜交種，包括包括茗科1號(編號：國審茶2002017)、黃觀音(編號：國審茶2002015)、黃奇(國審茶2002018)、金牡丹(編號：國品鑒茶2010024)、黃玫瑰(編號：國品鑒茶2010025)、瑞香(編號：國品鑒茶2010017)紫玫瑰(編號：閩審2005003)、春閨(編號：閩審2015001)、金茗早(新品系)等。黃棪作為高香優(yōu)質(zhì)的骨干親本，在我國茶樹育種中具有極高的代表性。
近日， Horticulture Research在線發(fā)表了福建農(nóng)林大學葉乃興教授團隊和中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所張興坦研究員團隊題為Genetic basis of high aroma and stress tolerance in the oolong tea cultivar genome的研究論文。該文章通過PacBio CCS和Hi-C測序結合ALLHiC算法，首次組裝獲得烏龍茶品種‘黃旦’的二倍體染色體級別基因組與兩套單體型染色體級別基因組。
該研究獲得了國家級烏龍茶品種黃旦的二倍體染色體級別參考基因組，大小為2.94Gb，與使用流式細胞儀的測定結果一致。黃旦基因組的雜合度為2.79%-3.40%，contig N50達到2.61Mb，LAI值為16.16，BUSCO指數(shù)為95.0%，注釋獲得43779個蛋白質(zhì)編碼基因，70.75%的黃旦基因組序列被注釋為重復序列。黃旦與古茶樹DASZ之間具有最多的結構變異注釋基因，而烏龍茶品種黃旦與綠茶品種舒茶早和龍井43間的結構變異注釋基因與香氣途徑相關，表明結構變異可能影響黃旦的高香品種特性。
Fig. 4: Analysis of SVs and related genes.
結合SV、轉(zhuǎn)錄組和揮發(fā)物測定結果發(fā)現(xiàn)TPS家族基因的結構變異、廣泛且特異地高表達是黃旦品種高香特性的分子基礎。該研究通過比較基因組學觀察到低溫調(diào)控核心因子CBF在茶樹染色體上的串聯(lián)進化模式。
Fig. 6: Phylogenetic and tissue expression analysis of TPS genes from HD and SCZ.
此外，獲得高雜合性茶樹的兩組單體型基因組HA和HB，總共包含30條假染色體，其中HA長度為2.90Gb，HB為2.97Gb。BUSCO分析表明，HA和HB分別注釋87.7%和85.9%的保守單拷貝基因，而完整的BUSCO基因的注釋率為95.2%。兩組單體型基因組存在大量遺傳變異，包括2357萬個SNP，114萬個插入和113萬個缺失。59.38%(26000/43779)的編碼基因可定義為等位基因，平均相似度為92.6%，Ka/Ks比為0.61。
黃旦高質(zhì)量單體型基因組和二倍體基因組具有豐富的遺傳信息，可為茶樹的功能基因組學研究與精確分子育種奠定基礎。
基因組和轉(zhuǎn)錄組的原始數(shù)據(jù)和注釋數(shù)據(jù)均已上傳國家基因組信息中心網(wǎng)站https://bigd.big.ac.cn/，總編號為PRJCA003382。
此外，可通過百度云網(wǎng)盤下載，鏈接：https://pan.baidu.com/s/1R89umQRTmWpRSOow-4L3vA，提取碼：fafu。
福建農(nóng)林大學園藝學院/茶學福建省高校重點實驗室的葉乃興教授和中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所張興坦研究員為該論文的共同通訊作者，福建農(nóng)林大學2018級博士研究生王鵬杰和2019級碩士研究生余嘉鑫為該論文的共同第一作者，福建農(nóng)林大學楊江帆教授、金珊講師/博士、岳川副教授、高水練副教授、孫云教授、郭玉瓊教授、2018級碩士研究生陳帥也參與了該項研究。
該研究是在福建省“2011協(xié)同創(chuàng)新中心”中國烏龍茶產(chǎn)業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心專項(閩教科〔2015〕75號)、安溪茶葉重大科技創(chuàng)新專項、國家自然科學基金(31701874)、國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)(茶葉)產(chǎn)業(yè)技術體系建設專項資金項目(CARS-19)等項目的資助下完成。
通訊作者簡介
葉乃興，福建農(nóng)林大學教授，茶學學科主任，中國茶葉學會學術工作委員會委員，長期從事茶樹栽培育種與茶葉品質(zhì)化學研究，參與育成金觀音、黃觀音、金牡丹、悅茗香、紫牡丹、黃奇等國家級茶樹優(yōu)良品種;主編規(guī)劃教材2部，主編出版《白茶科學?技術與市場》《中國烏龍茶種質(zhì)資源利用與產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟研究》《福州茉莉花與茶文化系統(tǒng)研究》等茶學書著;在國內(nèi)外期刊發(fā)表學術論文150余篇;獲得福建省科學技術二等獎3項、三等獎2項;授權發(fā)明專利11件。榮獲中華優(yōu)秀茶教師、張?zhí)旄２枞~發(fā)展貢獻獎、閩茶之星等榮譽稱號。
原標題：
茶葉科技進展 | 福建農(nóng)林大學葉乃興教授團隊揭示高香優(yōu)質(zhì)烏龍茶品種‘黃旦’的單體型和二倍體參考基因組
來源：中國茶葉學會
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毫不夸張，基因組對于大部分人來說就是一本讀不懂的生命“天書”。當然，這本“天書”對于任何的生命都有著非常重要的意義。那么，茶領域的基因研究達到了什么水平？基礎科學研究對于茶產(chǎn)業(yè)發(fā)展又有哪些重要的意義？基因科技又如何助力茶產(chǎn)業(yè)發(fā)展？
5月17日，黃棪茶樹品種基因組研究成果系列報告會在安溪舉辦，眾多專家以專題報告的形式為大家答疑解惑，共同探討“茶文化、茶產(chǎn)業(yè)、茶科技”融合發(fā)展的新路徑。
1、首次破譯黃棪茶樹品種基因組
中國茶基礎科學研究的一項重大突破
黃棪，又名黃旦、黃金桂，原產(chǎn)于福建安溪。與安溪鐵觀音一樣，黃棪是首批國家級茶樹優(yōu)良品種，是福建省主栽的優(yōu)良茶樹品種。
近日，福建農(nóng)林大學葉乃興教授、楊江帆教授團隊和中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所張興坦研究員團隊組裝獲得了烏龍茶品種黃棪的二倍體染色體級別基因組與單體型染色體級別基因組，獲得了黃旦的基因組精細圖譜與等位基因變異，揭示了黃旦品種高香品種特性的基因組基礎。該研究成果已于今年5月1日在國際頂尖園藝期刊《HorticultureResearch》上發(fā)表。
△福建省科學技術協(xié)會副主席，福建農(nóng)林大學教授、博導楊江帆作專題報告
福建農(nóng)林大學茶學學科主任、教授葉乃興表示，鐵觀音、黃棪是閩南烏龍茶雙星閃耀的品種。黃棪不僅是國家烏龍茶新品種選育的對照種，而且作為高香優(yōu)質(zhì)骨干親本，育成了金觀音、黃觀音、金牡丹、瑞香等一系列國家級高香優(yōu)質(zhì)茶樹新品種。黃棪（黃旦）品種基因組的成功破譯，進一步提升了黃棪在茶樹品種與烏龍茶加工科學研究中的地位，同時提高了黃棪品種在茶學科研院所與行業(yè)中的知名度和顯示度。黃棪品種的高質(zhì)量單體型和二倍體基因組具有豐富的遺傳信息，可為茶樹的功能基因組學研究與精確分子育種奠定基礎。這也進一步證明了安溪茶葉種質(zhì)資源豐富，是“國家茶樹良種寶庫”。
△福建農(nóng)林大學茶學學科主任、教授葉乃興作專題報告
“茶樹基因組測序的意義在于，追溯遙遠的過去，預測不久的未來。茶樹基因組選擇育種，是一種科學‘算命’?！敝袊r(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員、博導張興坦說道。
△中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員、博導張興坦作專題報告
中國茶葉品種豐富，茶樹基因組龐大、高度雜合、重復序列比例極高等因素的影響，導致茶樹基因組組裝困難。黃棪茶樹品種基因組的破譯，是中國茶基礎科學研究領域的一項重大突破，同時也為安溪茶產(chǎn)業(yè)多元化和標準化的發(fā)展提供了科技基礎。
△福建農(nóng)林大學茶學專業(yè)博士王鵬杰作專題報告
2、全國首家“茶生態(tài)醫(yī)院”揭牌啟動
中國茶基礎科學研究領域的一項重大突破
同日，由福建農(nóng)林大學安溪茶學院、安溪縣農(nóng)業(yè)農(nóng)村局共建科教實踐基地“茶生態(tài)醫(yī)院”同時在福建農(nóng)林大學安溪茶學院揭牌啟動。這是全國首家“茶生態(tài)醫(yī)院”，以服務高效生態(tài)茶園建設為宗旨，主要功能是茶園土壤修復與改良、茶園測土配方施肥、茶園生態(tài)綜合治理、茶樹病蟲害綠色防控和高效生態(tài)茶園建設與示范等。
△“茶生態(tài)醫(yī)院”揭牌儀式
“茶生態(tài)醫(yī)院”是由安溪縣政府籌集和安排相關項目資金和運行費用的非營利非法人組織，由福建農(nóng)林大學安溪茶學院聯(lián)合相關專家建立平臺、組建服務團隊、向社會提供茶園生態(tài)診斷與開展技術服務，實現(xiàn)校地企“互利三贏”。
福建省科學技術協(xié)會副主席，福建農(nóng)林大學教授、博導楊江帆表示：“茶是造福人類的健康飲料。種質(zhì)是我們農(nóng)業(yè)的基礎，生態(tài)是茶健康的基礎，這兩者都是我國茶業(yè)高質(zhì)量發(fā)展的重要基礎。安溪茶業(yè)是中國茶業(yè)乃至世界茶業(yè)的標桿，黃棪茶樹品種基因組的破譯和‘茶生態(tài)醫(yī)院’的成立，具有非常重要的意義?！?/p>
本次活動是“國際茶日”系列活動之一。會上，還舉行了安溪縣茶葉重大科技創(chuàng)新專項簽約儀式，福建農(nóng)林大學安溪茶學院、安溪縣農(nóng)業(yè)農(nóng)村局共建科教實踐基地“茶生態(tài)醫(yī)院”簽約儀式，安溪縣茶園土壤配方施肥與生態(tài)改良技術服務項目合作簽約儀式，關于安溪茶學院發(fā)展、校地合作座談咨詢會，特邀學術講座等重要活動。
安溪縣人民政府副縣長肖印章表示，作為全國最大的產(chǎn)茶縣，近年來，安溪堅持以推進茶業(yè)高質(zhì)量發(fā)展為主線，堅持綠色發(fā)展，強化數(shù)字賦能，厚植文化底蘊，穩(wěn)一產(chǎn)、強二產(chǎn)、優(yōu)三產(chǎn)，致力建設現(xiàn)代茶業(yè)強縣，成為全國茶業(yè)發(fā)展先行者和領軍人。
安溪素有“國家茶樹良種寶庫”美譽，茶樹種質(zhì)資源豐富多樣，栽培品種達100多個，在1985年首批認定的30個國家茶樹良種中，安溪獨占六席。此次黃棪茶樹品種基因組研究取得突破性進展，以及“茶生態(tài)醫(yī)院”的啟動建設，將為安溪以政產(chǎn)學研用，聚力共繪現(xiàn)代農(nóng)業(yè)藍圖，再添濃墨重彩的一筆。同時，對破解黃棪品種高香優(yōu)質(zhì)遺傳密碼、建立安溪茶樹種質(zhì)資源大數(shù)據(jù)具有重要的意義。這也讓我們看到，安溪這個茶業(yè)大縣，始終走在產(chǎn)業(yè)的前沿，切實以科技為茶產(chǎn)業(yè)賦能，促進安溪茶業(yè)綠色發(fā)展、躍升發(fā)展。
攝影：溫華香
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1.安溪鐵觀音
鐵觀音原產(chǎn)于福建安溪縣，屬烏龍茶之極品。因成茶沉似鐵，茶香濃郁，制茶人疑為觀音所賜，故名。安溪唐代已產(chǎn)茶，明代稍盛，鐵觀音于乾隆初年創(chuàng)制，至今有兩百余年歷史。
鐵觀音原是茶樹品種名，原產(chǎn)地和主產(chǎn)區(qū)在安溪縣西部的“內(nèi)安溪”，為“四季有花常見雨，一冬無雪卻聞雷”之地。 鐵觀音樹種別名紅心觀音或紅樣觀音，其它如紅英觀音、白心尾觀音、白樣觀音及薄葉觀音均非純種。純種鐵觀音茶樹的特征為：樹冠披展，枝條斜生，葉形橢圓；葉尖下垂略歪，葉緣齒疏而鈍，略向背面翻卷；葉肉肥厚，葉面呈波浪隆起，有明顯肋骨形；葉色濃綠油光，嫩梢肥壯，略帶紫紅?！凹t芽歪尾桃”為純種鐵觀音茶樹特征之一。
安溪鐵觀音制作嚴謹，技藝精巧。一年分四季采制。谷雨至立夏為春茶，產(chǎn)量占全年總產(chǎn)量45％－50％；夏至至小暑為夏茶，占25％－30％；立秋至處暑為暑茶，占15％－20％；秋分至寒露為秋茶，占10－15％。其中以春茶最好。秋茶次之，香氣特高，俗稱秋香，但湯味較薄。夏茶暑茶品質(zhì)較茶。
優(yōu)質(zhì)鐵觀音茶條卷曲、壯結、沉重。砂綠色，紅點明顯。具有蜻蜓頭、螺旋體、青蛙腿、砂綠帶白霜四大特點。湯色金黃，濃艷清澈，葉底肥厚明亮，具綢面光澤，有“綠底紅鑲邊”之稱。滋味醇厚甘鮮，香銳而濃，“七泡有余香”，俗稱“觀音韻”。
鐵觀音的品飲，沿襲傳統(tǒng)的“功夫茶”方式，陶制小壺沖泡，小杯品飲。異香撲鼻，回甘雋永，極之享受。
福建鐵觀音茶的概念，即以鐵觀音樹種制成的烏龍茶。而在臺灣，鐵觀音茶則指以鐵觀音特點制法制成的烏龍茶，至于樹種是否鐵觀音，是不相干的了。
2.武夷巖茶（優(yōu)者有大紅袍，肉桂，水仙，水金龜?shù)龋?/span>
產(chǎn)于福建武夷山的烏龍茶，統(tǒng)稱武夷巖茶，品種花色數(shù)以百計，茶名繁雜。武夷從唐朝生產(chǎn)蒸青團茶起，至明末罷貢茶后，武夷茶葉生產(chǎn)發(fā)展很大。巖茶積歷代制茶經(jīng)驗之精髓而創(chuàng)制，品質(zhì)十分優(yōu)異。武夷巖為中國最早出口歐洲的茶葉，風靡海外。
武夷山懸崖絕壁，深坑巨谷。茶農(nóng)利用巖凹、石隙、石縫，沿邊砌筑石岸，構成“盆栽式”茶園，俗稱“石座作法”。“巖巖有茶，非巖不茶”，巖茶由此得名。武夷山方圓60公里，99名巖，巖巖產(chǎn)茶。
武夷巖品種分類極多。以產(chǎn)地分為：正巖茶、半巖茶、洲茶。正巖茶指武夷巖中心地帶所產(chǎn)茶葉，品質(zhì)最佳，巖韻最顯。武夷山茶樹品種資源豐富，蘊藏無數(shù)優(yōu)異品種。茶人往往選擇生長優(yōu)良的茶樹若干叢，分別采制，品質(zhì)上佳，稱之為武夷名叢。著名者有武夷四大名叢之大紅袍、白雞冠、鐵羅漢、水金龜。
巖茶的采摘不同于其它茶類，要求掌握中開面開采。新梢伸育形成駐芽時，采3－4葉，此時第一葉伸平，葉面積為第二葉三分之一。春茶為谷雨后立夏前，夏茶在夏至前，秋茶則在立秋后。最好的采摘時間是上午9－11時，下午14－17時，雨天露水烈日均不采。名叢的鮮葉，需分開付制，務使盡善盡美。
武夷名叢以大紅袍最享聲譽，可謂“茶中之圣”。大紅袍產(chǎn)于天心巖九龍窠的高巖峭壁之上，巖頂終年有細小甘泉滴落，滋潤茶地，并帶來蘚苔類有機物，肥沃土地。大紅袍茶樹為千年古樹，稀世之珍?，F(xiàn)僅存6株（上4下2）。每年5月13日至15日，高架云梯采之。產(chǎn)量稀少，每兩售價高達數(shù)萬元。市面上之大紅袍為移植樹種所制。成品茶香氣濃郁，滋味醇厚，有明顯“巖韻”特征，飲后齒頰留香，經(jīng)久不退，沖泡9次猶存原茶之桂花香真味。
肉桂，又名玉桂，清朝已負盛名。因香氣似桂皮而得名。歷年產(chǎn)量極少，50年代后著意培育，產(chǎn)量逐漸增大。與武夷茶傳統(tǒng)品質(zhì)相反，肉桂香氣易成但滋味難求，制作時不易掌握。上好的肉桂桂皮香中帶乳香，沖泡四、五次后仍有余香；入口醇厚回甘，齒頰留香；湯色橙黃清澈，葉底黃亮，紅點明顯，呈綠葉紅鑲邊狀；條索勻整，緊結卷曲，色澤褐綠，油潤有光，部分葉背有青蛙皮狀小白點。
3.永春佛手
產(chǎn)于福建永春縣，乃佛手品種茶樹制成的烏龍茶。1919年，佛手茶苗由安溪移植到永春。30年代初，少量佛手茶開始轉(zhuǎn)銷國外。
佛手茶樹品種有紅芽佛手與綠芽佛手兩種（以春芽顏色區(qū)分），以紅芽為佳。鮮葉大的如掌，橢圓形，葉面扭曲不平，葉肉肥厚，主脈彎曲，葉緣鋸齒稀疏，葉色黃綠油光。
永春佛手茶分四季采摘，春茶占40％。采摘標準為新梢展開四至五葉，頂芽形成駐芽時采下二、三葉。一般是午后采，傍晚制。
成品茶茶條緊結肥壯，卷曲，色澤砂綠烏潤，香濃銳，味甘厚，耐沖泡，湯色橙黃清澈。
4.黃金桂
黃金桂，以黃（木炎）品種茶樹嫩梢制成的烏龍茶，因湯色金黃，奇香似桂花，故名。產(chǎn)于安徽安溪縣。在產(chǎn)區(qū)，毛茶多成黃（木炎）或黃旦，黃金桂為成茶商品名。黃（木炎）樹種于1860年移植至安溪，原樹存活至1967年。
黃金桂為早芽種，一般4月中旬采摘，比鐵觀音早12－18天。采摘標準為，新梢伸育形成駐芽后，頂葉呈小開面或中開面時采下二、三葉。過嫩則成茶香低味苦，過老則味淡薄，香粗次。
黃金桂成茶條索緊細，色澤潤亮金黃，香氣帶桂花香，滋味醇細甘鮮；湯色金黃明亮；葉底中間黃綠，邊緣朱紅。
5.閩北水仙
閩北水仙，烏龍茶類之上品。該茶原產(chǎn)于百余年前閩北之建陽縣水吉鄉(xiāng)大湖村一帶?，F(xiàn)主要產(chǎn)區(qū)為建毆、建陽兩縣。光緒年間產(chǎn)量曾達500噸，暢銷海外?，F(xiàn)閩北水仙占閩北烏龍茶之百分之六、七十，地位舉足輕重。
兩產(chǎn)區(qū)地域毗鄰，群山起伏，溪流縱橫，云霧繚繞，竹木蒼翠。所植水仙品種茶樹，枝條粗壯，鮮葉呈橢圓形，葉肉厚，表面革質(zhì)，有油光，芽葉透黃綠色。
春茶于谷雨前后采摘駐芽第三、四葉。每年分四季采制。
成茶條索緊結沉重，葉端扭曲，色澤油潤暗砂綠，呈“蜻蜓頭，青蛙腿”狀；香氣具蘭花清香；滋味醇厚回甘；湯色清澈橙黃，葉緣朱砂紅邊或紅點，即“三紅七青”。
茶葉那個品牌好？
暖莘茶：
一葉好茶來之不易，從種茶，管茶，采茶，挑茶，炒茶，制茶，在不斷找產(chǎn)地，選標準，尋好茶這包含了初心夢想旅途中的艱辛汗水，包含了幾代人，一輩茶人的心血和用心，我們不生產(chǎn)茶，我們只設計茶，尋一葉中國好茶，標準化，規(guī)?；?，復制化以降低好茶的成本，為消費者提供一葉好。
暖莘茶以堅持一葉好茶，暖一片人心的理念：以為大眾尋找中國好茶為宗旨，對茶我們堅持四不原則：
1.非原產(chǎn)地不選2.非原生態(tài)不選3.非高標準不選4.非好口感不選
因此并非每一葉茶都叫暖莘茶。夢想起航，十年三千六百五十個日夜，一百二多萬公里，環(huán)繞中國六十圈，萬里苦尋，品茶無數(shù)，只為尋找一葉中國好茶，敬您一杯暖莘茶，好茶才暖心。
暖莘茶對產(chǎn)品提出了更高的要求，比如在原有工藝上，每個環(huán)節(jié)有提出了更高的標準，有些行業(yè)工序，這里要經(jīng)過兩次以上的篩選或檢核以確保在高品質(zhì)的標準上，在二次以上提高，因此暖莘茶品質(zhì)是比較值得肯定的。
