明太祖朱元璋歷行“茶馬政策”，于洪武二十四年（公元１３９１年）下詔“廢團(tuán)茶，興葉茶”，促進(jìn)了炒青綠茶的發(fā)展。但云南地處邊垂，未經(jīng)中原統(tǒng)治，并未受其影響。
至明末清初，西南各省屢遭兵燹戰(zhàn)亂，清人揮兵南下平定三藩之亂后，重建統(tǒng)治秩序，恢復(fù)和發(fā)展原有的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)，又一次帶來中原先進(jìn)的制(炒)茶技術(shù)。
公元1644年清朝建立后，云南各地先后收歸清政府統(tǒng)治，雍正四年（公元1726年），清政府指派的云南總督鄂爾泰在云南推行“改土歸流”政策,雍正七年（公元1729年）設(shè)置普洱府治于寧洱，列普洱茶為貢茶，獻(xiàn)于皇室，使普洱茶進(jìn)入了一個(gè)歷史上的輝煌時(shí)期。
清人倪蛻于《滇云歷年志》（卷二）（公元1737年）記載：“雍正七年己酉，總督鄂爾泰奏設(shè)總茶店于思茅，以通判司其事。六大山產(chǎn)茶，向系商民在彼地坐放收發(fā)，各販於普洱，上納稅課轉(zhuǎn)行，由來久矣。至是以商民盤剝生事，議設(shè)總茶店，以籠其利權(quán)。于是通判朱繡上議，將新舊商民悉行驅(qū)逐，逗遛復(fù)入者俱枷責(zé)押回。其茶令茶戶盡數(shù)運(yùn)至總店，領(lǐng)給價(jià)值，私相買賣者罪之。稽查嚴(yán)密，民甚難堪。又商販先價(jià)后茶，通融得濟(jì)，官民交易，緩急不通。且茶山之于思茅，自數(shù)十里至千余里不止，近者且有交收守候之苦，人役使費(fèi)繁多，輕戥重秤，又所難免，然則百斤之價(jià)，得半而止矣。若夫遠(yuǎn)戶，經(jīng)月往來，小貨零星無幾，加以如前弊孔，能不空手而歸?小民生生之計(jì)，只有此茶，不以為資，又以為累。何況文官責(zé)之以貢茶，武官挾之以生息，則截其根，赭其山，是亦事之出于莫可如何者也。”
在雍正七年，云南總督鄂爾泰奏請(qǐng)朝庭，于思茅廳選址設(shè)立官辦的茶葉總店，指派朱繡任通判之職，親自掌管總茶店，對(duì)普洱茶實(shí)行專賣制，六大茶山所產(chǎn)之茶，茶農(nóng)采制后需全數(shù)運(yùn)交位于思茅的總茶店，待選辦貢茶入貢后方分由民間販賣。
雍正十二年（公元1734年）的官方文告《禁壓買官茶告渝》中有“每年應(yīng)辦貢茶，系動(dòng)公件銀兩，發(fā)交思茅通判承領(lǐng)辦送”的文字，可知當(dāng)時(shí)的普洱茶，雖產(chǎn)于六大茶山，但是集中于思茅集散，貢茶采辦亦在思茅。
清朝以來，普洱茶進(jìn)入一個(gè)歷史的極盛期，清·阮?！镀斩栌洝罚ü?825年)謂之:“普洱茶名遍天下。味最釅，京師尤重之。”
這一時(shí)期，也是普洱茶花色品種與制作工藝高速發(fā)展的時(shí)期，清·張泓《滇南新語》（公元1755年)載：“滇茶有數(shù)種：生性者曰木邦，曰普洱。木邦葉粗味澀，亦作團(tuán)，冒普茗名，以愚外販，因其地相近也，而味自虐。普茶珍品，則有毛尖、芽茶、女兒之號(hào)。毛尖即雨前所采者，不作團(tuán)，味淡香如荷，新色嫩綠可愛；芽茶較毛尖稍壯，采治成團(tuán)，以二兩四兩為率，滇人重之；女兒茶亦芽茶之類，取于谷雨后，以一斤至十斤為一團(tuán)，皆夷女采治，貨銀以積為奩資，故名。制撫例用三者充歲貢，其余粗普葉，皆散賣滇中。最粗者熬膏成餅?zāi)∮?，備饋遺。而歲貢中亦有女兒茶膏。并進(jìn)蕊珠茶，茶為祿豐山產(chǎn)，形如甘露子差小，非葉，特茶樹之萌茁耳，可卻熱疾。”
張泓記述的云南茶，不僅有產(chǎn)于六大茶山的普洱茶，還有鄰近地區(qū)產(chǎn)的木邦茶，木邦茶粗老滋味澀，也做成團(tuán)茶形式，不法商人用來冒充普洱茶，欺騙外來客商。
而真正的普洱茶分為嫩度極高的毛尖散茶；嫩芽制的二兩、四兩重的團(tuán)形芽茶；還有跟芽茶相同嫩度的谷雨后采制的一斤至十斤一團(tuán)的女兒茶。這三種普洱茶制品，加上產(chǎn)于祿豐山采剛蔭發(fā)的芽尖制成珠形幼嫩綠茶的蕊珠茶,都是用來進(jìn)獻(xiàn)朝庭的貢茶。而其它較粗老一些的茶葉，則分散于市面銷售。
這時(shí)期還出現(xiàn)了一種形式奇特的茶制品，是用最粗的茶葉熬煮成膏，做成餅的樣子，這種茶膏，清《本草綱目拾遺》載“黑如漆，醒酒第一，綠色者更佳，消食化痰，清胃生津，功力尤大也”，在其卷六《木部》又載“普洱茶膏能治百病，如肚脹、受寒，用姜湯發(fā)散，出汗即愈；口破喉顙，受熱疼痛，用五分噙口，過夜即愈；受暑擦破皮血者，研敷立愈”。但也有用較嫩的女兒茶熬制的茶膏，是貢茶花色的一種,進(jìn)于宮庭。
到19世紀(jì)，阮福《普洱茶記》又多了幾種新的制品形式：“于二月間采蕊極細(xì)而白，謂之毛尖，以作貢，貢后方許民間販賣，采而蒸之，揉為團(tuán)餅；其葉之少放而尤嫩者，名芽茶；采于三四月者，名小滿茶；采于六七月者，名谷花茶；大而圓者，名緊團(tuán)茶；小而圓者，名女兒茶，女兒茶為婦女所采，于雨前得之，即四兩重團(tuán)茶也；其入商販之手，而外細(xì)內(nèi)粗者，名改造茶；將揉時(shí)預(yù)擇其內(nèi)而不卷者，名金玉天；其固結(jié)而不改者，名疙瘩茶,味極厚難得。”
金玉天，就是后世所稱黃片，較粗老揉不成條；疙瘩茶，即后世所稱茶頭，是茶葉中茶膠豐富，解茶時(shí)粘成一團(tuán)打不散的，味道濃厚，極難得。
另外還有一種改造茶，就是把毛茶老嫩分開，把粗老茶團(tuán)在里面包心，細(xì)嫩茶撒在外面蓋面，然后蒸軟后壓制成形，這種制法改變了歷史以來毛茶分季節(jié)、檔次分別加工的單一形式，將不同季節(jié)、不同等級(jí)的茶葉混合加工，使低檔茶的經(jīng)濟(jì)價(jià)值得以提升，同時(shí)也形成了后世拼配茶的雛形，這種方式一種被沿用至今，成為加工大宗貨品的通用方式。
